Non essendo presenti ribosomi all´interno del citoplasma assonico, compreso il terminale, le proteine dell´assone vengono sintetizzate nel soma e trasportate verso l´assone. Questo movimento prende il nome di trasporto assoplasmatico. Il materiale viene incapsulato all´interno di vescicole che si spostano lungo i microtuboli dell´assone. Il movimento avviene grazie ad una proteina, la chinesina, e il processo è carburato dall´adenosintrifosfato (ATP). La chinesina muove solamente il materiale dal soma verso il terminale. Ogni movimento di materiale in questa direzione è chiamato trasporto anterogrado. Esiste anche un meccanismo per il movimento di materiale dal terminale verso il soma, il trasporto retrogrado. Si pensa che questo processo fornisca segnali al soma riguardo ai cambiamenti nei bisogni metabolici del terminale assonico. Il meccanismo molecolare è simile al trasporto anterogrado, ma il movimento viene fornito da una diversa proteina, la dineina.
